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熒光原位雜交-武漢貝科新肽(圖)

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基因組原位雜交技術(shù)基因組原位雜交(Genome in situ hybridization,GISH)技術(shù)是20世紀(jì)80年代末發(fā)展起來(lái)的一種原位雜交技術(shù)。它主要是利用物種之間DNA同源性的差異,熒光原位雜交,用另一物種的基因組DNA以適當(dāng)?shù)臐舛茸鞣庾瑁诎腥旧w上進(jìn)行原位雜交。GISH技術(shù)初應(yīng)用于動(dòng)物方面的研究(Pinkel et al.,1986),在植物上早應(yīng)用于小麥和栽培種的鑒定(余舜武等 2001;王文奎等 2000)。

植物組織原位雜交的步驟包括以下幾個(gè)方面:

1. 制備組織樣品:從植物中取出需要研究的組織樣品,如根、莖、葉等。

2. 固定組織樣品:將組織樣品固定在載玻片上,通常使用或乙醇等化學(xué)物質(zhì)進(jìn)行固定。

3. 處理組織樣品:對(duì)固定的組織樣品進(jìn)行脫水、透明化、脫脂等處理,以便于DNA探針的穿透和結(jié)合。

4. 制備DNA探針:根據(jù)需要研究的基因序列,設(shè)計(jì)并合成DNA探針。DNA探針可以標(biāo)記熒光染料或性同位素,以便于檢測(cè)。

5. 雜交DNA探針:將DNA探針與組織樣品進(jìn)行雜交,通常需要在高溫下進(jìn)行,以便于DNA探針與RNA或DNA結(jié)合。

6. 檢測(cè)雜交信號(hào):通過(guò)熒光顯微鏡或計(jì)數(shù)器等設(shè)備,檢測(cè)DNA探針與RNA或DNA的結(jié)合情況,確定目標(biāo)基因的表達(dá)模式和位置。

以菌落原位雜交為例:對(duì)分散在若干個(gè)瓊脂平板上的少數(shù)菌落(100-200)進(jìn)行篩選時(shí),可采用該方法。將這些菌落歸并到一個(gè)瓊脂主平板以及已置于第二個(gè)瓊脂平板表面的一張纖維素濾膜上。經(jīng)培養(yǎng)一段時(shí)間后,對(duì)菌落進(jìn)行原位裂解。主平板應(yīng)貯存于4℃直至得到篩選結(jié)果。

將少數(shù)菌落轉(zhuǎn)移到纖維素濾膜上

(1) 在含有選擇性的瓊脂平板上放一張纖維素濾膜。

(2) 用無(wú)菌牙簽將各個(gè)菌落先轉(zhuǎn)移至濾膜上,再轉(zhuǎn)移至含有選擇性但未放濾膜的瓊脂主平板上。應(yīng)按一定的格子進(jìn)行劃線接種(或打點(diǎn))。每菌落應(yīng)分別劃線于兩個(gè)平板的相同位置上。后,在濾膜和主平板上同時(shí)劃一個(gè)含有非重組質(zhì)粒的菌落。

(3) 倒置平板,于37℃培養(yǎng)至劃線的細(xì)菌菌落生長(zhǎng)到0.5-1.0mm的寬度。

(4) 用已裝防水黑色繪圖墨水的針頭穿透濾膜直至瓊脂,在3個(gè)以上的不對(duì)稱(chēng)位置作標(biāo)記。在主平板大致相同的位置上也作上標(biāo)記。

(5) 用Parafilm膜封好主平板,倒置貯放于4℃,直至獲得雜交反應(yīng)的結(jié)果。

(6) 裂解細(xì)菌,按本段下面所述方法,使釋放的DNA結(jié)合于纖維素濾膜。

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