但各種識別算法終都歸結為在指紋圖像上找到并比對指紋的特征。這就是指紋識別技術的基本原理，即采集指紋圖像并進行比對指紋特征。因為這些應用中所使用的采集器往往面積較小，較難完整地采集到中心點和三角點。交叉和小島由于計算上的困難，在實際的系統(tǒng)中往往不予采用。光學式指紋識別主要包括4個方面功能：指紋模塊負責采集指紋圖像。數(shù)字信號處理器主要把采集到的指紋圖像轉化為數(shù)字信號。

用棱鏡將其投射在電荷耦合器件上CMOS或者CCD上，進而形成脊線（指紋圖像中具有一定寬度和走向的紋線）呈黑色、谷線（紋線之間的凹陷部分）呈白色的數(shù)字化的、可被指紋設備算法處理的多灰度指紋圖像。然后對比資料庫看是否一致。當我們把手指放在指紋考勤機上時，通過鏡面反射原理，指紋模塊就會采集指紋圖像，接著指紋圖像就會被數(shù)字信號處理器轉換成數(shù)字信號。從普遍意義上來講，可以定義指紋的兩類特征來進行指紋的驗證：總體特征和局部特征。

在登記過程中，用戶需要先采集指紋，人臉識別指紋門禁系統(tǒng)，然后計算機系統(tǒng)將自動進行特征提取，提取后的特征將作為模板保存在數(shù)據(jù)庫或其他的地方。在很多場合，用戶可能還要輸入其他的一些輔助信息，以幫助系統(tǒng)進行匹配，如帳號、用戶名等。此過程是一個通用的過程，對所有的生物特征識別技術都適用。有人曾提出用汗腺孔來進行指紋識別，但這種方法要求指紋采集設備要具有非常高的分辨率。所以在實際的系統(tǒng)中沒有采用。